Na FTC, as atividades de pesquisa estão incluídas em cinco grandes áreas do conhecimento:
- Ciências Sociais Aplicadas;
- Ciências Biológicas;
- Ciências Exatas e da Terra;
- Ciências da Saúde;
- Ciências Humanas;.
A FTC possui 16 grupos de pesquisa cadastrados no CNPq; com 94 pesquisadores, sendo mais de 90 % doutores e 113 estudantes de Graduação, Mestrado (do programa de Mestrado em Bioenergia da FTC e da UFBA) e Doutorado (UFBA) que realizam as atividades de pesquisa nas dependências das Unidades da Rede FTC.
Os grupos de pesquisa são multidisciplinares e transdisciplinares, envolvendo professores de uma mesma área ou de áreas distintas.
